Tanulmányai utolsó évében felvette a karmesterképző szakot is, ahol Lukács Ervin és Gál Tamás voltak a tanárai. 1995-ben diplomázott. Ugyanebben az évben második helyezést kapott és közönségdíjat nyert a Magyar Televízió nemzetközi karmesterversenyén. 1996-ban a spanyolországi Cadaques-ben rendezett karmesterversenyen ugyancsak második díjas, 1997-ben pedig a Portugál Rádión nemzetközi karmesterversenyén első helyezett lett.

1995-től egy évig Vásáry Tamás mellett dolgozott és vezette a Magyar Rádió ifjúsági szimfonikus zenekarát. 1996 óta a Zeneakadémia óradíjas tanára. Karmesterként szerződtette a Budapesti Filharmóniai Társaság, a MATÁV Szimfonikus Zenekar, a Magyar Állami Operaház és a Debreceni Csokonai Színház. 1997 őszén Kocsis Zoltán zeneigazgató javaslatára az akkor még Magyar Állami Hangversenyzenekar nevet viselő Nemzeti Filharmonikusok első állandó karmesterévé nevezték ki. Hamar Zsolt ezeken túlmenően 2000. óta a Pécsi Szimfonikus Zenekar zeneigazgatója.